С 1997 г. Народная украинская академия является экспериментальной площадкой Министерства образования Украины и автором учредителем регионального экспериментального комплекса по обработке нового образовательного модуля. Вследствие этого вся деятельность университета подчинена реализации научно-исследовательского проекта по становлению и развитию учебного заведения нового типа, представляющего собой модель непрерывного образования.
Научно-исследовательская деятельность НУА ведется в следующих приоритетных направлениях:
• Разработка комплексной научной тематики в соответствии с планом работы на 2006-2020 гг.;
• Развитие научных школ НУА;
• Развитие эксперимента по обработке нового образовательного модуля;
• Публикация результатов научных трудов по комплексной тематике;
развитие соискательства, аспирантуры и докторантуры как источника повышения квалификации научно-педагогических кадров;
• Деятельность Студенческого научного общества и Совета молодых ученых.
Научно-исследовательская работа осуществляется в различных формах: проводятся научные конференции и семинары различного уровня, ежегодно издается сборник статей, работают научные кружки на кафедрах, действует Совет молодых ученых.